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      西南大學(xué)科研團(tuán)隊(duì)繪就家蠶超級(jí)泛基因組圖譜

      發(fā)布時(shí)間:2022-10-10 作者:胡航宇 來源:中國教育新聞網(wǎng)

      中國教育報(bào)-中國教育新聞網(wǎng)訊(記者 胡航宇)10月9日,西南大學(xué)發(fā)布最新科研成果,家蠶基因組生物學(xué)國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室團(tuán)隊(duì)歷時(shí)四年,完成家蠶大規(guī)模種質(zhì)資源基因組解析(“千蠶基因組”),繪就家蠶超級(jí)泛基因組圖譜。該研究在世界上率先實(shí)現(xiàn)家蠶基因庫數(shù)字化,創(chuàng)建“數(shù)字家蠶”,對(duì)于深化功能基因組研究和推進(jìn)家蠶模式化,開啟家蠶設(shè)計(jì)育種,賦能“改造家蠶、多元利用”等,將產(chǎn)生深遠(yuǎn)的影響。

      家蠶是重要的經(jīng)濟(jì)昆蟲和新興模式生物,但之前僅有單一參考基因組及部分重測序,尚不足以支撐基因組變異和優(yōu)良基因的深度挖掘。家蠶基因組生物學(xué)國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室主任、國家蠶桑產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系首席科學(xué)家代方銀教授介紹,研究團(tuán)隊(duì)對(duì)1078份蠶種質(zhì)資源(205份地方種,194份改良種,632份遺傳材料,47份野桑蠶)進(jìn)行了深度測序,產(chǎn)生55.57T基因組數(shù)據(jù),組裝了545個(gè)蠶的高質(zhì)量基因組,對(duì)100個(gè)基因組進(jìn)行了基因注釋,鑒定到4300余萬個(gè)SNP、930余萬個(gè)InDel、340余萬個(gè)結(jié)構(gòu)變異(SV)和7308個(gè)新基因(家族),繪制了一個(gè)高精度家蠶泛基因組圖譜。

      該超級(jí)泛基因組囊括了目前最全面的家蠶和野桑蠶基因組信息,是迄今全球動(dòng)植物領(lǐng)域最大的長讀長泛基因組。同時(shí),對(duì)蠶的各種遺傳變異、群體結(jié)構(gòu)、人工選擇和生態(tài)適應(yīng)性及經(jīng)濟(jì)性狀開展了深入的研究,取得豐碩的創(chuàng)新結(jié)果。其研究論文于今年9月24日在國際名刊《自然通信》(Nature Communications)在線發(fā)表。

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